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内蒙古医学院创建于1956年，是新中国在少数民族地区最早建立的一所高等医药院校，当时隶属国家卫生部，后划归内蒙古自治区管理。建院初期，原北京医科大学、中国医科大学、哈尔滨医科大学等著名高校的一批专家、教授支边来内蒙古医学院工作，为学院的发展奠定了坚实的基础。 　　 改革开放以来，在党的基本路线、教育方针和民族政策的指引下，学院得到了快速发展和长足进步，形成了“严谨、求实、团结、奋进”的良好校风，教学质量、学术水平和医疗技术不断提高，成为了内蒙古自治区医学教育的龙头，发挥着示范、辐射和带动作用。如今，学院设有基础医学院等十一个教学单位、两所成人教育分院和一所卫生技术学校。开设临床医学、中医学、药学、护理学、麻醉学、口腔学、影像学、医学检验，药品营销，眼视光技术等31个本专科专业和9个专业方向。有4个学科门类（医学、理学、工学、管理学），有21个学科和专业具有硕士学位授予权。学院现有各级各类在校生10000余人，形成了以培养本科生为主，同时培养研究生、专科生、留学生的多层次，多专业，多形式的办学格局。学院新购置土地1400余亩规划建设的新校区一期工程五大单体建筑已基本完工，并将投入使用。 　　内蒙古自治区心血管研究所和骨科研究所设在内蒙古医学院。学院设有药物研究所、蒙药研究所和眼科等9个研究室。拥有3个自治区重点学科、2个自治区重点实验室、6个自治区临床医学领先学科、4个自治区临床医学重点学科和5个自治区基础医学与预防医学重点实验室。学院建有分子生物学中心、化学实验中心、电镜中心、计算机网络中心、动物实验中心及8个大型多媒体教室和5个大型语音教室。为实现教育资源的共同开发和合理利用，学院已将所有实验室整合完毕，在全院建立实验室的二级管理模式。学院每年积极筹措资金用于重大科研项目建设，科研工作逐步得到加强。学院图书馆是全国医学文献资源共享网络省级中心馆之一，建有电子图书馆和大型电子阅览室